1. Ensemble des microbes présents dans ou sur un organisme vivant, par exemple un être humain. [Dictionnaire médical de l'Académie de Médecine]
2. Population de micro-organismes vivant en accord avec son hôte.
Le microbiote intestinal humain est à ce jour constitué de plus de 500 espèces différentes connues.
3. Le microbiote est l'ensemble des micro-organismes (bactéries, levures, champignons, virus) vivant dans un environnement spécifique (appelé microbiome) chez un hôte (animal ou végétal). Par exemple, le microbiote intestinal, couramment appelé « flore intestinale », est constitué de l'ensemble des micro-organismes vivant dans l'intestin soit chez l'Humain environ 100 000 milliards. Chaque humain abrite 200 à 250 espèces.
4. Le microbiote de l'organisme humain, anciennement dénommé flore microbienne de l'organisme humain, est l'ensemble des bactéries, microchampignons et autres micro-organismes que le corps humain contient en grand nombre. Le plus étudié des microbiotes humains est le microbiote intestinal. Le microbiote intestinal est extrêmement divers (biodiversité taxonomique, génétique et fonctionnelle). Il varie selon les individus et fluctue dans le temps, surtout dans les mois qui suivent la naissance et en période de maladie.
5. Le microbiote intestinal est l'ensemble des micro-organismes ( archées, bactéries, eucaryotes ) qui se trouvent dans le tube digestif des animaux. Il ne s'agit pas uniquement de bactéries intestinales, mais également de celles de l'estomac.
6. Le microbiote est l'ensemble des micro-organismes ? bactéries, microchampignons, protistes ? vivant dans un environnement spécifique ( appelé microbiome ) chez un hôte ( animal : zoobiote ; végétal : phytobiote ; sol : microbiote tellurique ; air : aérobiote ) ou une matière ( d'origine animale ou végétale ) . Ces micro-organismes peuvent être présents sans impact sur leur hôte ( commensalisme ) ou entrer en interaction étroite avec lui ( mutualisme, parasitisme non létal ) . Chaque organisme impliqué est qualifié de microbionte ou symbionte, par opposition au pathobionte , micro-organisme opportuniste résidant au sein du microbiome, et potentiellement pathogène.
